Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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SYCP1Q15431 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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SYCP1Q15431 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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SYCP1Q15431 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYCP1Q15431 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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