Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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