Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERV3-1Q14264 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms