Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
RASGRF1Q13972 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASGRF1Q13972 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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