Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKP1Q13835 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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