Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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