Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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NCOA4Q13772 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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NCOA4Q13772 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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NCOA4Q13772 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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NCOA4Q13772 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NCOA4Q13772 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NCOA4Q13772 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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