Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTMR3Q13615 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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