Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DNASE1L3Q13609 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms