Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA5AQ13591 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms