Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NAE1Q13564 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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