Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 GSK3A-203ENST00000453535 1897 ntTSL 531.35■■■□□ 2.612e-7■■□□□ 14
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PABPC4Q13310 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.832e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.582e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SLC2A4RG-207ENST00000493772 1328 ntTSL 1 (best)24.37■■□□□ 1.492e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SLC2A4RG-202ENST00000473157 991 ntTSL 321.42■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.277e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.767e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.637e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.247e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.667e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.717e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.897e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.778e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.668e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.148e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.018e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.688e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.688e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.648e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-207ENST00000598979 893 ntTSL 318.14■□□□□ 0.498e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.288e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.168e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.148e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CASC3-202ENST00000394114 2792 ntTSL 26.49□□□□□ -1.371e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-16■■□□□ 14
PABPC4Q13310 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.543e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.173e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 AL603832.3-205ENST00000606954 680 ntTSL 218.13■□□□□ 0.491e-7■■□□□ 14
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PABPC4Q13310 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.82□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 29.77□□□□□ -0.845e-12■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.474e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.933e-8■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-10■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PSMB5-201ENST00000334454 796 ntTSL 522.6■■□□□ 1.214e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.732e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-214ENST00000534312 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-207ENST00000525763 789 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-209ENST00000527926 633 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 STXBP2-212ENST00000597467 821 ntTSL 327.16■■□□□ 1.942e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 527.16■■□□□ 1.942e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 424.77■■□□□ 1.562e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 415.8■□□□□ 0.122e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 213.34□□□□□ -0.272e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 FAM3A-218ENST00000475657 585 ntTSL 217.46■□□□□ 0.393e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.244e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ZCCHC7-205ENST00000481507 903 ntTSL 27.22□□□□□ -1.254e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.444e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.29e-8■■□□□ 14
PABPC4Q13310 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.962e-8■■□□□ 14
PABPC4Q13310 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.632e-8■■□□□ 14
PABPC4Q13310 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.51e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.496e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GTF2A2-201ENST00000267869 518 ntTSL 317.54■□□□□ 0.46e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.376e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GTF2A2-202ENST00000396060 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPL8-206ENST00000528296 540 ntTSL 320.66■□□□□ 0.99e-37■■□□□ 14
PABPC4Q13310 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.972e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.712e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 214.53□□□□□ -0.087e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-44■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-44■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-44■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.232e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 212.81□□□□□ -0.368e-11■■□□□ 14
PABPC4Q13310 KCMF1-202ENST00000428691 560 ntTSL 222.18■■□□□ 1.143e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.483e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 KCMF1-203ENST00000453448 625 ntTSL 35.92□□□□□ -1.463e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 MDN1-204ENST00000487831 689 ntTSL 27.03□□□□□ -1.281e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 FAM173A-208ENST00000570237 475 ntTSL 221■□□□□ 0.951e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ETFA-201ENST00000267950 1289 ntTSL 525.32■■□□□ 1.641e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ETFA-220ENST00000565910 609 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 29.57□□□□□ -0.887e-45■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CCT8-203ENST00000432178 556 ntTSL 24.69□□□□□ -1.667e-45■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPL8-211ENST00000531975 698 ntTSL 315.01□□□□□ -0.011e-36■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-213ENST00000533403 1847 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-202ENST00000395850 1889 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CD59-203ENST00000415002 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.861e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-206ENST00000482860 2599 ntTSL 26.91□□□□□ -1.31e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 24.75□□□□□ -1.651e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 13.9
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