Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF6Q13247 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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