Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPA4Q13156 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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