Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CALCOCO2Q13137 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CALCOCO2Q13137 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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