Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM2Q13029 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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