Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms