Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTPN13Q12923 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms