Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM115Q12893 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms