Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CNTN1Q12860 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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