Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TROQ12816 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROQ12816 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TROQ12816 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROQ12816 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROQ12816 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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