Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXO1Q12778 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms