Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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AP1B1Q10567 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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AP1B1Q10567 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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AP1B1Q10567 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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AP1B1Q10567 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AP1B1Q10567 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms