Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC173Q0VFZ6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms