Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms