Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB2Q08289 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms