Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms