Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PSME1Q06323 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms