Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTDSPL2Q05D32 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms