Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPN12Q05209 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms