Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms