Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCNT1Q02742 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms