Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYP27A1Q02318 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CYP27A1Q02318 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms