Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POU5F1Q01860 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POU5F1Q01860 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms