Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms