Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIM1P81133 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIM1P81133 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIM1P81133 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms