Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB1AP62820 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB1AP62820 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB1AP62820 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB1AP62820 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms