Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPS3AP61247 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms