Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFC1P60507 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms