Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP6P59044 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms