Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NME5P56597 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NME5P56597 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NME5P56597 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms