Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BGRP55822 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms