Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC13P55735 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC13P55735 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC13P55735 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms