Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH15P55291 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms