Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC11A1P49279 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms