Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms