Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATRXP46100 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms