Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM5CP41229 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM5CP41229 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms