Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGCXP38435 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.7 ms