Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPARGP37231 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPARGP37231 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms